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悟達國師，在未受封國師之前，是個名叫知玄的和尚，年少時代參訪叢林，在長安京都某寺掛單，遇到了一位僧人。這位僧人生了一種「迦摩羅」的惡疾，通身生瘡，發出衝鼻難聞的穢氣，誰都厭惡和他來往，但知玄住於他隔壁，憐愍他的病苦，常常自動去照顧他，連一點討厭躲避的臉色都沒有。
後來病僧的病好了，感激知玄的德風道義，就對他說：「我要走了，你以後會有難臨身，不妨到四川彭州九隴山來找我，我會設法解救你的災難。記住在有兩棵大松樹並立的標誌，那就是我居住地方。」
後來，知玄和尚因為德行高深，唐懿宗十分崇敬，就封他為悟達國師。受封以後，住持安國寺，德名益彰，懿宗皇帝並親自求教佛法，更賜沈香莊飾寶座，座高二丈許。然而就從這時開始，他卻不幸在膝蓋上生出一個人面瘡來，有眉有眼，有口有齒，與人面一樣，每天需要飲食餵他，瘡像人一樣開口啖食。知玄和尚痛苦萬分，召請了各地名醫，都拱手遜稱無藥可醫。
就在群醫束手，瘡疾日烈時，突然記起當年那位病僧臨別所說的話。於是前往西蜀入山去尋找。一日，傍晚時分，山路難行，正不知如何是好時，忽然看見兩梱並立的松樹，心中大喜，快步走向前去，只見廣闊的殿堂，金碧輝煌，那位僧人已站在門前，兩人相見萬分欣喜，國師便把所患的怪疾的痛苦相告。僧人對他說：「不要緊的，我這兒山巖下有清泉，等到明日去洗一下就會好的。」
翌日清晨，僧人命一孩童帶路，引領國師到巖下清泉之畔。國師剛用手捧起水準備洗膝上人面瘡時，不料痴竟出聲大呼：「不要洗！不要洗！」國師驚問：「為什麼？」瘡說：「您曾否讀過西漢史書，袁盎與晁錯傳呢？」國師回答：「曾讀過」。人面瘡就譏諷地說：「您既然讀過了，何以不知袁盎殺晁錯的事？往昔的袁盎就是你，而晁錯是我。當吳楚七國造反時，你在帝前讒我，致使斬我於東市，這冤深恨重，累世以來，我總想尋求機會報復，可是你十世以來，都是高僧，持戒十分精嚴，冥冥中有戒神在旁保護，使我無法近身報復。如今，由於你受皇上的恩寵，待遇豐厚，已到了奢侈揮霍地步，而動了希名欲利的心念，無形中陰德已損，因這緣故，才能接近報復你。現在，蒙迦諾尊者出面調解，賜我三昧法水，令我解脫，那麼我們之間的夙冤，也告終結，從今以後，我不再和你為難作對。」
國師聽了，非常震恐，連忙掬水來洗，一時痛入骨髓，暈絕在地不省人事。復甦後，覺得左腿已安然無恙，人面瘡已不知去向。由此遂明白聖賢渾跡世間，不是凡情所可以測度的。國師欲回寺禮謝那位僧人，但金碧輝煌的崇樓寶殿，已杳無蹤影。於是他築一茅菴，自此不再下山。
悟達國師因蒙迦諾迦尊者垂慈，為他解了多生宿冤，為報答此特殊廣大恩德，如經云：「若不說法度眾生，畢竟無有報恩者。」並為後人啟懺悔之門，所以才著此「慈悲三昧水懺」，意取尊者以三昧水洗人面瘡，解積世冤業的緣故。
《慈悲三昧水懺》，共三卷，係依宗密大師之《圓覺經修證儀著錄》而成，收於大正藏第四十五冊。本懺是以淨除三障為因，成佛成聖為果。主旨在解冤釋結，消除往昔罪惡，迴向無上菩提。
